http://proyectopinguino.blogspot.com/2008/08/instalar-programas-en-linux.html hay algo llamado google wn... puedes buscar guias ahi Dx
si usas ubuntu puedes instalas desde el menu de centro de software en aplicaciones o por teminal sudo apt-get install (nombre del programa)
depende de la distro y como venga el software. por ejemplo puede venir empaquetado para tu distro, .deb para debian y variantes(ubuntu) o .rpm para Red-hat y variantes (fedora) o en un ejecutable .sh usuario@maquina:lacarpeta/# sh ./quiero_abrir_esto.sh por lo general cuando bajas un ejecutable en algún lugar dice como instalar y que permisos debe tener, no es windows. para ganar a click, aquí acostumbren a leer más.