En las últimas cuatro semanas se ha producido un aumento significativo de nuevas infecciones por SARS-CoV-2 en la provincia de Gauteng [Sudáfrica], que se ha atribuido a la nueva variante Omicron anunciada el 24 de noviembre de 2021. Los primeros casos de Omicron se detectaron en el distrito de Tshwane [Sudáfrica] y coincidieron con el fuerte aumento de nuevas infecciones, lo que anuncia el inicio de la cuarta oleada en Gauteng.
Tshwane ha sido el epicentro global del brote de Omicron y de la cuarta oleada de la provincia de Gauteng, con un aumento exponencial del número de casos semanales durante varias semanas, hasta alcanzar algo más de 8.569 casos en la semana epidemiológica 47 (del 21 de noviembre al 27 de noviembre) y 41.921 hasta el 3 de diciembre, antes del final de la semana epidemiológica 48 (del 28 de noviembre al 4 de diciembre). El aumento exponencial de casos ha continuado con 9.929 nuevos casos notificados en Tshwane en los últimos 5 días, del 29 de noviembre al 3 de diciembre de 2021 (Figura 1).
Informamos sobre la experiencia inicial del perfil del paciente en el complejo hospitalario Steve Biko/Tshwane District en Pretoria, en el corazón del distrito de Tshwane.
Figura 1. Nuevos casos diarios de SARS-CoV-2 del 29 de noviembre al 3 de diciembre de 2021 (sacronavirus.co.za)
Es esencial reconocer que la información sobre los pacientes presentada aquí sólo representa las dos primeras semanas de la oleada de Omicron en Tshwane. El perfil clínico de los pacientes ingresados podría cambiar significativamente en las próximas dos semanas, momento en el que podremos sacar conclusiones sobre la gravedad de la enfermedad con mayor precisión.
Aunque el NICD ha confirmado que casi todos los casos de SARS-C0V-2 en Tshwane se deben a la nueva variante, no hemos podido establecer que en todos los casos la variante sea Omicron, ya que la máquina de PCR que se utiliza en el laboratorio del SBAH no detecta el gen S. Se está asumiendo razonablemente que los casos descritos aquí representan la infección con la nueva variante.
La principal observación que hemos hecho en las dos últimas semanas es que la mayoría de los pacientes de las salas de COVID no han sido dependientes del oxígeno. El SARS-CoV-2 ha sido un hallazgo incidental en pacientes que ingresaron en el hospital por otra razón médica, quirúrgica u obstétrica.
Tabla 1. Instantánea del perfil de los pacientes el 2 de diciembre de 2021
Este es un cuadro que no se ha visto en las oleadas anteriores. Al principio de las tres oleadas anteriores y a lo largo del curso de estas oleadas, siempre ha habido sólo una pizca de pacientes con aire ambiente en la sala COVID y estos pacientes han estado generalmente en la fase de recuperación a la espera de la resolución de una comorbilidad antes del alta. La sala de COVID se reconoce, porque la mayoría de los pacientes reciben algún tipo de suplemento de oxígeno con el sonido incesante de las máquinas de oxígeno nasal de alto flujo o las alarmas de los ventiladores.
Sólo hay 4 pacientes en cuidados intensivos y uno en la UCI. El número de pacientes en cuidados intensivos con doble oxígeno, oxígeno nasal de alto flujo o ventilación no invasiva (VNI) era notablemente mayor en las oleadas anteriores. Esto es anecdótico, pero lo confirman numerosos clínicos que han trabajado previamente en las salas de COVID del complejo hospitalario.
De los 38 adultos que se encontraban en las salas de COVID el 2 de diciembre de 2021, 6 estaban vacunados, 24 no estaban vacunados y 8 tenían un estado de vacunación desconocido. De los 9 pacientes con neumonía por COVID, 8 no están vacunados y 1 es un niño. Sólo un paciente con oxígeno estaba totalmente vacunado, pero el motivo del oxígeno era la enfermedad pulmonar obstructiva crónica.
Tabla 2. Estado de vacunación de los pacientes con SARS-CoV-2 por tipo de sala el 2 de diciembre de 2021
Una pregunta clave en relación con el nuevo brote de Omicron es si la gravedad de la enfermedad es similar, más leve o más grave que con las otras variantes, dado el gran número de mutaciones de Omicron.
El mejor indicador de la gravedad de la enfermedad es la tasa de mortalidad hospitalaria. En la cohorte de SBAH/TDH se produjeron 10 muertes en las últimas dos semanas, lo que supone el 6,6% de los 166 ingresos. Cuatro muertes se produjeron en adultos de 26 a 36 años y cinco (5) en adultos mayores de 60 años. Una muerte fue en un niño en el que la causa de las muertes no estaba relacionada con el COVID. No hubo ninguna muerte relacionada con el COVID entre los 34 ingresos en las salas pediátricas de COVID durante las dos últimas semanas. Esto se compara favorablemente con la proporción de muertes en el complejo durante los últimos 18 meses, que fue del 17%. La tendencia en las próximas dos semanas se aclarará, ya que el número de muertes es actualmente bajo, y habrá transcurrido el tiempo suficiente para que se desarrolle una mayor gravedad de la enfermedad y se pueda esperar que el número de muertes aumente. Por el momento, las tasas de mortalidad de las dos últimas semanas, así como las de los últimos 18 meses en el complejo SBAH/TDH, son inferiores a la tasa global de mortalidad intrahospitalaria del 23% para el país en todas las oleadas anteriores, según ha informado NICD.
La figura 2 muestra la ausencia de un aumento significativo de las muertes intrahospitalarias en relación con el espectacular aumento de la tasa de casos para el conjunto de la provincia de Gauteng. Esto puede deberse al habitual desfase entre los casos y las muertes, y la tendencia se aclarará en las próximas semanas.
Figura 2. NUEVAS tasas de casos de SARS-CoV-2 y de muertes por COVID-19 en la provincia de Gauteng (gráfico cortesía del profesor Jonny Myers, UCT) (la línea roja sólida indica la fecha de inicio de la vacunación)
Figura 1. Nivel de atención de los pacientes en las dos últimas semanas
En la tabla 1, 3 de los 4 pacientes de la sala de cuidados intensivos tenían un diagnóstico primario de neumonía por COVID grave, por lo que podría ser que el perfil más reciente esté cambiando a una enfermedad por COVID más grave. Se está llevando a cabo un análisis más detallado de los pacientes de cuidados intensivos que podría ser más revelador.
Para medir con mayor precisión la gravedad de la enfermedad en los individuos hospitalizados es necesario revisar los hallazgos de la radiografía de tórax o de la tomografía computarizada de pulmón (porcentaje de campos pulmonares que muestran cambios), las medidas de gases en sangre, los biomarcadores sanguíneos y el efecto concomitante de las comorbilidades en el estado del paciente. Varios equipos de investigadores están realizando a nivel local estudios detallados de las medidas brutas y más precisas de la gravedad de la enfermedad, y el equipo del Steve Biko está participando en estos estudios.
Una de las primeras conclusiones significativas de este análisis es que la duración media de la estancia de los pacientes seropositivos al SARS-CoV-2 admitidos en las salas del COVID ha sido mucho más corta, de 2,8 días, en comparación con la duración media de la estancia de 8,5 días en los últimos 18 meses. NICD informa en su informe semanal de una duración de la estancia similar a la de todos los hospitales de Tshwane. También es inferior a la duración media de la estancia en Gauteng o en el país, según NICD en oleadas anteriores.
En resumen, la primera impresión que se desprende del examen de los 166 pacientes ingresados desde que apareció la variante Omicron, junto con la instantánea del perfil clínico de 42 pacientes que se encuentran actualmente en las salas de COVID del complejo SBAH/TDH, es que la mayoría de los ingresos hospitalarios son por diagnósticos no relacionados con el COVID-19. La positividad del SARS-CoV-2 es un hallazgo incidental en estos pacientes y se debe en gran medida a la política del hospital que exige la realización de pruebas a todos los pacientes que requieren ingreso en el hospital.
Utilizando la proporción de pacientes con aire en la habitación como marcador de ingreso incidental por COVID en contraposición a la COVID grave (neumonía), el 66% de los pacientes del complejo SBAH/TDH son ingresos incidentales por COVID. Este cuadro tan inusual también se da en otros hospitales de Gauteng. El 3 de diciembre, el Hospital Helen Joseph tenía 37 pacientes en las salas de COVID, de los cuales 31 estaban en aire ambiente (83%); y el Hospital Académico Dr. George Mukhari tenía 80 pacientes, de los cuales 14 estaban en oxígeno suplementario y 1 en un ventilador (81% en aire ambiente).
El aumento exponencial de la tasa de positividad en estos pacientes es un reflejo del rápido aumento de la tasa de casos en Tshwane, pero no parece estar asociado a un aumento concomitante de la tasa de ingresos por COVID grave (neumonía), en base a la elevada proporción de pacientes que no requieren oxígeno suplementario.
El número relativamente bajo de hospitalizaciones por neumonía COVID-19 en las salas generales, de cuidados intensivos y de UCI constituye un cuadro muy diferente en comparación con el inicio de las oleadas anteriores. Todavía se está llevando a cabo un análisis detallado en el que se compara el panorama actual con las oleadas anteriores. Es muy posible que esto tenga que ver con el repunte temprano de la cuarta oleada, y que el patrón más clásico se haga evidente en las próximas dos semanas. Sin embargo, lo que está claro es que el perfil de edad es diferente al de las oleadas anteriores. Es posible que se trate de un efecto de la vacunación, ya que el 57% de las personas mayores de 50 años se han vacunado en la provincia, frente al 34% del grupo de 18 a 49 años.
La elevada proporción de pacientes adultos con COVID incidental y el mayor número de ingresos positivos al SARS-CoV-2 entre los niños de 0 a 9 años pueden reflejar mayores tasas de transmisión en la comunidad en comparación con olas anteriores (variantes) que no se están traduciendo en mayores tasas de ingreso para un diagnóstico primario de COVID-19. Se necesita más tiempo para responder plenamente a las preguntas sobre la gravedad de la COVID-19 causada por la nueva variante Omicron.
Ver más: Tshwane District Omicron Variant Patient Profile – Figures and Tables
Autor: Dr. Fareed Abdullah
El Dr. Fareed Abdullah es el Director de la Oficina de Investigación sobre el SIDA y la tuberculosis en el SAMRC y un clínico de VIH a tiempo parcial en el Hospital Académico Steve Biko. Desde el comienzo de la pandemia de COVID-19 ha trabajado como miembro del equipo clínico de COVID-19 durante las tres primeras oleadas de la epidemia.
Agradecimientos:
- Profesor Jonny Myers, UCT
- Profesora Glenda Gray, Presidenta y Directora General del SAMRC
- Profesora Veronica Ueckermann y médicos de alto nivel del Departamento de Medicina Interna Steve Biko
- Profesor Deb Basu y colegas del Departamento de Salud Pública de la Universidad de Pretoria
- El Dr. Raj Ramlall y los médicos del Hospital de Distrito de Tswhane
- Dra. Lucille Blumberg, NICD y Right to Care
- Dra. Waasila Jassat y Dr. Richard Welch, NICD
Fuente: Tshwane District Omicron Variant Patient Profile – Early Features
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